概述
Element AVITI™ 系统彻底改造了表面化学物质、碱基检测和数据分析，为各种新一代测序应用提供灵活且经济高效的平台。将无与伦比的数据质量与运行效率，整合于台式仪器的平台内。AVITI系统兼容多种常用中低读长测序模式，可支持2 x 150 bp、2 x 100 bp、2 x 75 bp、2 x 50 bp、2 x 25 bp 多种测序读长。设备具有双流动槽支持同时、独立运行不同读长检测，赋予AVITI足够的灵活性。
系统
1. Element专有的Avidity短读长测序试剂能够带来其他台式系统无法比拟的数据质量和成本效益。
2. AVITI系统可独立运行两个流动槽，每个可产出300Gb数据，为用户带来极大的灵活性。
3. AVITI操作软件也具有可调节读取通量的功能，在运行时间方面带来了更多的灵活性。
4. 简单的NGS文库制备兼容性，无PCR工作流程允许用户立即开始文库制备
5. 开放生信分析，FASTQ文件输出，没有分析的专有要求
参数
流程
创新性的测序化学
与边合成边测序（SBS）不同，亲和力测序的关键创新在于，它将检测掺入的核苷酸与延伸DNA模板分离开来。分离步骤可使每个过程独立优化，使得AVITI成为成本和精度更高 的DNA测序系统。
亲和力测序利用avidites（亲和子）的独特特性来进行高效的测序反应，从而产生高度准确的数据。这种精度的主要驱动因素之一是强信噪比，即使在高密度polony的情况下也能持续存在。在运行开始时，文库与覆盖流动槽表面的引物杂交。然后，扩增聚合酶与文库和引物的双链体结合，催化滚环扩增（RCA）并产生包括原始文库拷贝的长DNA链。每一条链都形成了一个polony，其 中包含数百份原始文库的副本。Polonies与读取特异性测序引物杂交。
每个循环开始于测序聚合酶将亲和子与polony和引物双链体的结合，将碱基特异性亲和子结合到polony上进行成像，并形成一个极其紧密的复合物，与边合成边测序技术（SBS）相比，试剂浓度可降低100倍，从而节省了每个样品的成本。成像后，亲和子被移除，然后未标记荧光的核苷酸结合到测序引物之后，以进行一个碱基的引物延伸。其后开始另一个循环。
5. 开放生信分析，FASTQ文件输出，没有分析的专有要求
扩增方式的优势
RCA仅使用初始链作为模版进行扩增，可避免扩增错误的放大。这种扩增方式同样限制了标签跳跃（index hopping）和optical duplicates的影响。
标签跳跃会将reads指派到错误的样本上，它通常在不使用RCA扩增的高通量系统上比较显著。RCA避免了游离标签引物与polonies的结合，从而最小化了流动槽上的标签跳跃。Optical duplicates在当软件将一个大的polony当作两个小的polony并分开计算读取时发生。在AVITI系统上optical duplicates的比率低至<1%，这样可获得更多有效reads。
完整的NGS流程
AVITI系统具有整合了文库准备、测序和分析在内完整的端对端的NGS流程。Element Biosciences与各个文库制备和分析公司合作验证了Element的解决方案，并且使得平台转化工作十分便捷。AVITI系统终身保证试剂成本，可为未来的运行成本提供保障，无须凑样即可迅速得到结果。
应用
单细胞/RNA测序
与10x Genomics. BD Rhapsody和Parse Biosciences相兼容的，经验证的单细胞方案
Low-pass测序
结合AVT1测序和 Gencove分析，根据不同的定制方案，可提供高性价比的解決方案
外显子和靶向测序
可实现每张流动槽8-24个外显子或每次运行16-48个外显子的实验室内tumor-normal研究
全基因组测序
行业领先的精度助力变异发现，同时兼容FFPE样本
