概述
BioSkryb Genomics 的 ResolveDNA?采用PTA (Primary Template-directed Amplification)原代模板定向扩增技术,其核心要点在于,采用抗核酸外切酶活性的终结子 (化学修饰的核苷酸) 实现拟线性扩增 (quasi-linear process),绝大多数扩增子来源于原始模板的扩增,扩增产物无法再次被复制,因此扩增过程产生的错误不会被放大,并且Phi29 DNA 聚合酶可减少扩增错误率,此外,还可以扩增线粒体基因组 (Mitochondrial Genome)。该技术可将单细胞核内微量的DNA高保真、高均一、高产率地扩增至可测序水平,灵敏、准确地检测各种基因变异(包括单细胞SNV和CNV),实现超过95%的基因组覆盖及优于其他方法的高保真性和均一性。系统
无论是低起始量的DNA样本还是单细胞都可以进行精确扩增,可捕获大于95%的基因组,并且具有很高的重现性。
以高覆盖度、低复制错误和低等位基因偏差进行均一性扩增,
在全基因组测序 (WGS)、全外显子组测序 (WES) 和small panel水平准确检测单核苷酸变异 (SNV)。
1.起始量为4pg~10ng
2.拟线性扩增
扩增片段的长度受控(免于后续片段化流程,同时减少偏好)
双链产物 (可直接连接反应建库)
扩增产物无法作为模板再次复制(避免错误和偏好性放大)
3.一致的、从单细胞起始可达μg级的收率
可满足后续稳定高质量的建库流程
可满足后续PCR-Free的分析流程
4.重现性好,极低的NTC对照收率
可对同一样品进行重复分析 (Cell-to-cell Reproducibility)
只有目标模板可被扩增,非特异性扩增的发生率极低
参数
无论是低起始量的DNA样本还是单细胞都可以进行精确扩增,可捕获大于95%的基因组,并且具有很高的重现性。
以高覆盖度、低复制错误和低等位基因偏差进行均一性扩增,
在全基因组测序 (WGS)、全外显子组测序 (WES) 和small panel水平准确检测单核苷酸变异 (SNV)。
1.起始量为4pg~10ng
2.拟线性扩增
扩增片段的长度受控(免于后续片段化流程,同时减少偏好)
双链产物 (可直接连接反应建库)
扩增产物无法作为模板再次复制(避免错误和偏好性放大)
3.一致的、从单细胞起始可达μg级的收率
可满足后续稳定高质量的建库流程
可满足后续PCR-Free的分析流程
4.重现性好,极低的NTC对照收率
可对同一样品进行重复分析 (Cell-to-cell Reproducibility)
只有目标模板可被扩增,非特异性扩增的发生率极低